台湾疫情从5月中进入第三级警戒后，迄6月7日确诊已经累积到11,491例，合计有286人死亡，死亡案例中有18％从发病到死亡不到3天，当局“担心有特别状况”正在检测基因。由于疫情严峻，中央流行疫情指挥中心宣布将三级警戒延长至6月28日，而全国各级学校也配合停止到校上课至暑假，且超商、卖场、超市、百货即日起採取“1人1坪、1进1出”管制，防堵病毒扩散。
指挥官陈时中7日宣布新增214例，分别为211例本土个案及3例境外移入个案，确诊案例较少不排除是周末两天筛检的人数较少所致；确诊个案分布地区仍以新北市82例最多，其次为台北市60例。
此外，确诊个案中新增26例死亡，其中有3个采检是无症状，甚至有不少人在确诊翌日就死亡。对此，指挥中心专家谘询小组召集人张上淳表示，会请疾管署昆阳实验室进行基因检测进行探讨，“也担心是不是有什么特别状况。”
张上淳表示，近期染疫殁案例仍以60岁以上高龄者居多，其中有四成案例从发病到死亡介于8到14天，另有些人仅发病两三天后便死亡，占18％。
有13例死亡后确诊 政府鼓励厂商引进在家就能做的快筛
另有13例在死亡后才确诊，引人忧心是否有确诊黑数藏在社区。陈时中强调，确实要尽早找出确诊者，让黑数降到一个程度，传播链就会断了。指挥中心现时鼓励厂商进口让民众在家就能做的快筛，扩大筛检量能，也纾解紧绷的筛检压力。
由于本土疫情持续严峻，指挥中心宣布将全国疫情警戒第三级延长至6月28日止，全国各级学校也配合停止到校上课至暑假，指考也延到7月底。总统蔡英文下午透过网路直播发表谈话说，端午节（6月14日）就要到了，“端午节明年还有，留在原地不要移动，就是我对大家最大的请托。”
超商卖场超市百货 採“1人1坪、1进1出”管制人流
陈时中重申，民众外出须全程配戴口罩，不再劝导，会直接开罚。另外，休闲娱乐场所将严查不得营业，全国餐饮业一律外带，卖场及超市加强人流管制，并呼吁民众少去多买，一次购足；结婚不宴客，丧礼不公祭；宗教集会活动全面暂停办理。
针对超市、超商、百货、卖场，指挥中心物资组组长陈正祺说明，第一是加强管制人流，维持社交距离，民众少去多买，各卖场已明定核心营业时间，透过人流系统管制系统，以卖场坪数（1人1坪为原则）控管人流，人流量过大时，须安排工作人员採1进1出方式管制人潮。
第二是大型百货及卖场可分别设置出入口，派员驻守门口进行出入口管制，落实顾客进行实联制、量体温、确实戴口罩，并提供顾客酒精消毒。
第三是公共场所定期消毒作业，如客厕、手扶梯、电梯、楼面客席、育婴室等消费者接触区域，严格执行定时清洁消毒，并提高消毒频率。
针对近期医院及长照机构感染事件，指挥中心已请全国医院停止开放探病（例外情形除外），住院病人的陪病者以1人为限，执行至全国三级警戒降级为止。至于长照机构，除停止开放机构住民探视，也要求非必要性特殊情况，尽量避免住民请假外出，并强化门禁管理，避免不必要的人员进出，并持续落实每日工作人员、服务对象与陪住人员等体温及健康监测，掌握其COVID-19暴露风险情形。
陈时中强调，目前对社区的管制有达到一定的效果，但若是强化社区管制，代价可能非常大，因此目前优先找出社区感染源头，强化家户管理的强度，希望继续维持争取时间，等待疫苗施打率提升。
针对台南市政府近日宣布推“守护台南行动”，除了退订端午节返乡火车票有奖金外，市民通报筛检确诊还有奖金，引发外界议论该做法是否违反中央规定。陈时中回应表示，若是强制措施，一定要指挥中心同意，若仅为奖励方式，则由地方政府视财政办理。
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